El CEMSE nació en la década de los 80’s y el objetivo principal de su creación respondía desde entonces a la necesidad de proporcionar igualdad de oportunidades para niñas, niños, adolescentes y jóvenes de menores posibilidades dentro del sistema educativo, accediendo a servicios que les permitieran mejorar la calidad de su aprendizaje y que además sean servicios (laboratorios, biblioteca, salas de computación) que no tuvieran dentro de sus Unidades Educativas. Así nació el CEMSE el año 1985, hasta el presente el CEMSE es el modelo de los Centros de Recursos Educativos, propuestos dentro de diferentes políticas educativas como un alternativa para la mejora de la educación fiscal en Bolivia.